Вюрцбургская архиепископская резиденция послужила троекратным пристанищем для императора Наполеона I. В последние два приезда, император приезжал со своей второй супругой Марией Луизой Австрийской. В то время, с 1806 по 1813 годы, великим герцогом Вюрцбурга был дядя императрицы, был Фердинанд III Тосканский. А в 1821 году, в стенах резиденции родился баварский принц Леопольд.
Князья архиепископы Вюрцбурга не жалели средств на украшение резиденции. Они приглашали истинных мастеров своего дела для выполнения намеченных работ. Джованни Баттиста Тьеполо расписал фресками потолки лестницы, придворную церковь и зал кайзера. Иоганнес Цик расписал садовый зал, а Антонио Джузеппе Босси оставил потомкам удивительные фрески в белом зале.
Работы в стиле рококо закончились со смертью Карла Филиппе фон Грейфенклау. Его преемники оформляли интерьеры уже в более скромном стиле короля Людовика XVI. Во время наполеоновского правления, Тосканские комнаты дворца оформили в стиле неоклассики с влиянием наполеоновского ампира.
Баварский принц Леопольд внес свой вклад в оформление своего «родильного дома». Благодаря его стараниям, в 1894 году, перед резиденцией открылся «Фонтан Франконии». Но самым незабываемым шедевром дворца, бесспорно, являются потолочные фрески над лестницей.
Вторая Мировая война оставила свой разрушительный след на Вюрцбургской Резиденции. 16 марта 1945 года на Вюрцбург посыпались авиабомбы союзных войск. Они нанесли значительный, но, к счастью, не фатальный урон дворцу. Хотя несколько залов было полностью разрушены, все же центральная часть резиденции не пострадала. Сохранились самые ценные фрески прославленных мастеров XVIII века.
При вступлении в Вюрцбург союзных войск, резиденцию законсервировали и приставили охрану к этому шедевру архитектуры. Это стало возможным благодаря усилиям искусствоведа Джона Скилтона из Америки. Начиная с 1960-х годов в резиденции начались реставрационные работы и продолжились они вплоть до ноября 2006 года. Потребовалось пятьдесят лет кропотливой работы художников – реставраторов. Истинно говорят, легче строить, чем восстанавливать…